MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Burkholderia sp. KJ006 chromosome 3

Total Repeats: 31924

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017922	CGG	2	6	96	101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017922	GCG	2	6	102	107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017922	CGC	2	6	117	122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_017922	CCGC	2	8	140	147	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5	NC_017922	GCC	2	6	163	168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_017922	CAC	2	6	174	179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_017922	GAA	2	6	199	204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387905814
8	NC_017922	CG	3	6	253	258	0 %	0 %	50 %	50 %	387905814
9	NC_017922	CGC	2	6	264	269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387905814
10	NC_017922	CGA	2	6	286	291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387905814
11	NC_017922	GCCG	2	8	330	337	0 %	0 %	50 %	50 %	387905814
12	NC_017922	CGG	3	9	352	360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387905814
13	NC_017922	GCG	2	6	423	428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387905814
14	NC_017922	CGAC	2	8	447	454	25 %	0 %	25 %	50 %	387905814
15	NC_017922	CGC	2	6	463	468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387905814
16	NC_017922	CG	3	6	473	478	0 %	0 %	50 %	50 %	387905814
17	NC_017922	GC	3	6	495	500	0 %	0 %	50 %	50 %	387905814
18	NC_017922	TGG	2	6	504	509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387905814
19	NC_017922	GAA	2	6	511	516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387905814
20	NC_017922	GCC	2	6	548	553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387905814
21	NC_017922	CG	3	6	563	568	0 %	0 %	50 %	50 %	387905814
22	NC_017922	TCG	2	6	594	599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387905814
23	NC_017922	CGA	2	6	601	606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387905814
24	NC_017922	GTC	2	6	623	628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387905814
25	NC_017922	GCG	2	6	640	645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387905814
26	NC_017922	GCC	3	9	686	694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387905814
27	NC_017922	CG	4	8	712	719	0 %	0 %	50 %	50 %	387905814
28	NC_017922	CG	4	8	730	737	0 %	0 %	50 %	50 %	387905814
29	NC_017922	GGC	2	6	739	744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387905814
30	NC_017922	CGC	2	6	882	887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387905814
31	NC_017922	GCCG	2	8	889	896	0 %	0 %	50 %	50 %	387905814
32	NC_017922	GCT	2	6	913	918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387905814
33	NC_017922	TCG	2	6	927	932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387905814
34	NC_017922	TGC	2	6	1017	1022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387905814
35	NC_017922	GC	3	6	1021	1026	0 %	0 %	50 %	50 %	387905814
36	NC_017922	GCT	2	6	1110	1115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387905814
37	NC_017922	GCT	2	6	1123	1128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387905814
38	NC_017922	ACG	2	6	1137	1142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387905814
39	NC_017922	TGC	2	6	1152	1157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387905814
40	NC_017922	GC	4	8	1175	1182	0 %	0 %	50 %	50 %	387905814
41	NC_017922	CGG	3	9	1189	1197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387905814
42	NC_017922	GCC	3	9	1243	1251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387905814
43	NC_017922	GC	3	6	1306	1311	0 %	0 %	50 %	50 %	387905814
44	NC_017922	CGGC	2	8	1365	1372	0 %	0 %	50 %	50 %	387905814
45	NC_017922	GCAT	2	8	1392	1399	25 %	25 %	25 %	25 %	387905814
46	NC_017922	CGCGC	2	10	1400	1409	0 %	0 %	40 %	60 %	387905814
47	NC_017922	GC	3	6	1443	1448	0 %	0 %	50 %	50 %	387905814
48	NC_017922	GCG	2	6	1483	1488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387905814
49	NC_017922	CG	3	6	1487	1492	0 %	0 %	50 %	50 %	387905814
50	NC_017922	GTT	2	6	1528	1533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387905814
51	NC_017922	GC	3	6	1534	1539	0 %	0 %	50 %	50 %	387905814
52	NC_017922	CG	4	8	1582	1589	0 %	0 %	50 %	50 %	387905814
53	NC_017922	GCTGC	2	10	1598	1607	0 %	20 %	40 %	40 %	387905814
54	NC_017922	GCG	2	6	1608	1613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387905814
55	NC_017922	CGG	2	6	1636	1641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387905814
56	NC_017922	CG	5	10	1642	1651	0 %	0 %	50 %	50 %	387905814
57	NC_017922	GCCG	2	8	1681	1688	0 %	0 %	50 %	50 %	387905814
58	NC_017922	CG	3	6	1703	1708	0 %	0 %	50 %	50 %	387905814
59	NC_017922	CACGAC	2	12	1715	1726	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	387905814
60	NC_017922	GCC	2	6	1745	1750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387905814
61	NC_017922	GCC	2	6	1757	1762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387905814
62	NC_017922	GC	3	6	1770	1775	0 %	0 %	50 %	50 %	387905814
63	NC_017922	GCC	2	6	1792	1797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387905814
64	NC_017922	GC	3	6	1798	1803	0 %	0 %	50 %	50 %	387905814
65	NC_017922	CG	4	8	1827	1834	0 %	0 %	50 %	50 %	387905814
66	NC_017922	CGG	2	6	1849	1854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387905814
67	NC_017922	GC	3	6	1879	1884	0 %	0 %	50 %	50 %	387905814
68	NC_017922	TGC	2	6	1887	1892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387905814
69	NC_017922	GGGCGC	2	12	1910	1921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017922	CGGG	2	8	1924	1931	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
71	NC_017922	CGTG	2	8	1947	1954	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_017922	GCG	2	6	1967	1972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_017922	GCCG	2	8	2000	2007	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_017922	GC	3	6	2008	2013	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_017922	CCGC	2	8	2043	2050	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
76	NC_017922	GCGG	2	8	2106	2113	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
77	NC_017922	CG	4	8	2128	2135	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_017922	GCG	2	6	2150	2155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017922	CGT	2	6	2173	2178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_017922	GTC	2	6	2180	2185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017922	GC	3	6	2191	2196	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_017922	GTG	2	6	2201	2206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017922	GCC	2	6	2221	2226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_017922	GCA	2	6	2272	2277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017922	GC	4	8	2279	2286	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_017922	CGTGC	2	10	2301	2310	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
87	NC_017922	TTG	2	6	2317	2322	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017922	G	6	6	2369	2374	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017922	CAC	2	6	2393	2398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_017922	C	6	6	2411	2416	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
91	NC_017922	TCG	2	6	2487	2492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017922	GAC	2	6	2582	2587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387905815
93	NC_017922	CGA	2	6	2602	2607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387905815
94	NC_017922	CG	3	6	2622	2627	0 %	0 %	50 %	50 %	387905815
95	NC_017922	CGCGGC	2	12	2635	2646	0 %	0 %	50 %	50 %	387905815
96	NC_017922	GCA	2	6	2727	2732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387905815
97	NC_017922	TCCG	2	8	2784	2791	0 %	25 %	25 %	50 %	387905815
98	NC_017922	CGG	2	6	2794	2799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387905815
99	NC_017922	GCT	2	6	2881	2886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387905815
100	NC_017922	TGC	2	6	2895	2900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387905815
101	NC_017922	GGCT	2	8	2918	2925	0 %	25 %	50 %	25 %	387905815
102	NC_017922	GCCG	2	8	2929	2936	0 %	0 %	50 %	50 %	387905815
103	NC_017922	TGC	2	6	2946	2951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387905815
104	NC_017922	CGG	2	6	2974	2979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387905815
105	NC_017922	CGG	2	6	2986	2991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387905815
106	NC_017922	CG	3	6	3025	3030	0 %	0 %	50 %	50 %	387905815
107	NC_017922	GC	3	6	3087	3092	0 %	0 %	50 %	50 %	387905815
108	NC_017922	GCT	3	9	3112	3120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387905815
109	NC_017922	TCG	2	6	3165	3170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387905815
110	NC_017922	GAA	2	6	3242	3247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387905815
111	NC_017922	GCG	2	6	3256	3261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387905815
112	NC_017922	GCC	2	6	3278	3283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387905815
113	NC_017922	CGGC	2	8	3295	3302	0 %	0 %	50 %	50 %	387905815
114	NC_017922	GCT	4	12	3325	3336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387905815
115	NC_017922	CGG	2	6	3337	3342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387905815
116	NC_017922	TCG	2	6	3345	3350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387905815
117	NC_017922	CGT	2	6	3361	3366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387905815
118	NC_017922	TGC	2	6	3375	3380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387905815
119	NC_017922	GCT	2	6	3448	3453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387905815
120	NC_017922	GAT	2	6	3466	3471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387905815
121	NC_017922	TGC	3	9	3474	3482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387905815
122	NC_017922	GGCT	2	8	3491	3498	0 %	25 %	50 %	25 %	387905815
123	NC_017922	TGG	2	6	3527	3532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387905815
124	NC_017922	TCG	2	6	3540	3545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387905815
125	NC_017922	GTT	2	6	3547	3552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387905815
126	NC_017922	TGA	2	6	3579	3584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387905815
127	NC_017922	TCG	2	6	3606	3611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387905815
128	NC_017922	CTG	2	6	3629	3634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387905815
129	NC_017922	CGG	2	6	3742	3747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387905815
130	NC_017922	GAT	2	6	3796	3801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387905815
131	NC_017922	CTA	2	6	3808	3813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387905815
132	NC_017922	ATG	2	6	3815	3820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387905815
133	NC_017922	TCG	2	6	3840	3845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387905815
134	NC_017922	CGG	2	6	3852	3857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387905815
135	NC_017922	CG	3	6	3867	3872	0 %	0 %	50 %	50 %	387905815
136	NC_017922	GCT	2	6	3873	3878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387905815
137	NC_017922	GCG	2	6	3885	3890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387905815
138	NC_017922	CG	3	6	3917	3922	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_017922	CGCC	2	8	3964	3971	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
140	NC_017922	CGG	2	6	3985	3990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_017922	GCG	2	6	4009	4014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_017922	GC	3	6	4035	4040	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
143	NC_017922	GGA	2	6	4041	4046	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017922	CG	3	6	4048	4053	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
145	NC_017922	CCGT	2	8	4055	4062	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
146	NC_017922	GGCGCT	2	12	4114	4125	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_017922	GAT	2	6	4203	4208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387905816
148	NC_017922	CGAAT	2	10	4240	4249	40 %	20 %	20 %	20 %	387905816
149	NC_017922	AAGG	2	8	4264	4271	50 %	0 %	50 %	0 %	387905816
150	NC_017922	CGAC	2	8	4289	4296	25 %	0 %	25 %	50 %	387905816
151	NC_017922	CGA	2	6	4452	4457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387905816
152	NC_017922	TCGAC	2	10	4481	4490	20 %	20 %	20 %	40 %	387905816
153	NC_017922	CGTG	2	8	4494	4501	0 %	25 %	50 %	25 %	387905816
154	NC_017922	A	7	7	4527	4533	100 %	0 %	0 %	0 %	387905816
155	NC_017922	CG	3	6	4558	4563	0 %	0 %	50 %	50 %	387905816
156	NC_017922	GAC	2	6	4571	4576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387905816
157	NC_017922	AAATG	2	10	4707	4716	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
158	NC_017922	GGA	2	6	4743	4748	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
159	NC_017922	GGA	2	6	4827	4832	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
160	NC_017922	CAC	2	6	5010	5015	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
161	NC_017922	CGG	2	6	5062	5067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
162	NC_017922	CTGG	2	8	5126	5133	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
163	NC_017922	GCA	2	6	5177	5182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387905817
164	NC_017922	GCT	2	6	5258	5263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387905817
165	NC_017922	TGA	2	6	5281	5286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387905817
166	NC_017922	CG	3	6	5295	5300	0 %	0 %	50 %	50 %	387905817
167	NC_017922	CGG	2	6	5320	5325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387905817
168	NC_017922	GGC	2	6	5332	5337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387905817
169	NC_017922	GGAC	2	8	5405	5412	25 %	0 %	50 %	25 %	387905817
170	NC_017922	TGCG	2	8	5437	5444	0 %	25 %	50 %	25 %	387905817
171	NC_017922	TGACGG	2	12	5503	5514	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	387905817
172	NC_017922	GAT	2	6	5525	5530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387905817
173	NC_017922	GCG	2	6	5641	5646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387905817
174	NC_017922	GCT	2	6	5663	5668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387905817
175	NC_017922	AC	3	6	5694	5699	50 %	0 %	0 %	50 %	387905817
176	NC_017922	GAA	2	6	5732	5737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387905817
177	NC_017922	GCG	2	6	5738	5743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387905817
178	NC_017922	TCG	3	9	5758	5766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387905817
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180	NC_017922	GCA	2	6	5918	5923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
181	NC_017922	TGA	2	6	5978	5983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
182	NC_017922	GCA	2	6	6038	6043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
183	NC_017922	CAA	2	6	6057	6062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
184	NC_017922	TCGAA	2	10	6210	6219	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
185	NC_017922	TGCG	2	8	6333	6340	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
186	NC_017922	CG	4	8	6363	6370	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
187	NC_017922	GTGC	2	8	6383	6390	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
188	NC_017922	ATCG	2	8	6440	6447	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
189	NC_017922	CGGCA	2	10	6459	6468	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
190	NC_017922	TCG	2	6	6503	6508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
191	NC_017922	ATC	2	6	6615	6620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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200	NC_017922	CG	3	6	6900	6905	0 %	0 %	50 %	50 %	387905818
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269	NC_017922	CG	3	6	8971	8976	0 %	0 %	50 %	50 %	387905819
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276	NC_017922	CGGC	2	8	9081	9088	0 %	0 %	50 %	50 %	387905819
277	NC_017922	CG	3	6	9126	9131	0 %	0 %	50 %	50 %	387905819
278	NC_017922	TCG	2	6	9168	9173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387905819
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289	NC_017922	TCG	4	12	9543	9554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
290	NC_017922	GCC	2	6	9557	9562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
291	NC_017922	CAT	2	6	9577	9582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
292	NC_017922	TAC	2	6	9587	9592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
293	NC_017922	GC	3	6	9625	9630	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
294	NC_017922	GGCC	2	8	9658	9665	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
295	NC_017922	TCA	2	6	9666	9671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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298	NC_017922	GC	3	6	9737	9742	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
299	NC_017922	CG	3	6	9788	9793	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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309	NC_017922	TCG	2	6	10179	10184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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312	NC_017922	CGT	2	6	10285	10290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
313	NC_017922	CGA	2	6	10294	10299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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399	NC_017922	AAT	2	6	12777	12782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
400	NC_017922	ACG	2	6	12811	12816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
401	NC_017922	GAC	2	6	12848	12853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
402	NC_017922	TGA	2	6	12883	12888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387905823
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407	NC_017922	GCG	2	6	13163	13168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387905823
408	NC_017922	CGTG	2	8	13188	13195	0 %	25 %	50 %	25 %	387905823
409	NC_017922	CGA	3	9	13217	13225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387905823
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482	NC_017922	TGC	2	6	15682	15687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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486	NC_017922	CCG	2	6	15791	15796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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491	NC_017922	GGC	2	6	15999	16004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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